En 1958, des extra-terrestres envahissent une tranquille petite ville de l'Illinois. En 1983, Margaret se rend à Centerville pour l'enterrement de sa mère et ne donne plus signe de vie. Son ex-mari, inquiet, se déplace à son tour en compagnie d'une journaliste et d'un homme dont la famille a également disparu, pour élucider le mystère. Peu à peu, il leur devient apparent qu'une collusion existe entre les plus hautes sphères de l'Etat et des extra-terrestres aux visées fort obscures et certainement inamicales...